Per oltre 200 anni, durante il periodo di isolamento del Giappone in epoca Edo, la piccola isola artificiale di Dejima nel porto di Nagasaki è stata l'unico punto di contatto e di scambio t
A nord dell'arcipelago di Goto, a ovest di Nagasaki, una catena di 17 piccole isole vulcaniche forma il comune Ojika, la cui principale isola ha lo stesso nome.
Nozaki è una piccola isola fuori Sasebo, a Kyushu. Adesso disabitata, nel XVII secolo essa era un rifugio per i "cristiani nascosti" nella regione di Nagasaki che fuggivano dalle persecuzioni.
